Docking moléculaire
2024-12-22
l'ancrage moléculaire Molecular docking
Article scientifique du professeur Dr. Samir Musharraf Khalaf.
Il n'est pas caché aux spécialistes dans divers domaines scientifiques comme le domaine de la pharmacie. Pharmacology et les toxines Toxicology et la science de la vieBiology et la biologie moléculaireMolecular Biology Et la chimie organique et biologique. Organic or Biochemistry ... Parmi les spécialités scientifiques qui s'occupent de l'efficacité moléculaire des protéines, le rôle important joué par l'ancrage moléculaire est tel qu'il n'y a presque pas de science parmi les autres qui ne soit pas en interaction avec ce sujet, par exemple, sans limitation, la microbiologie. Microbiology Et ce que cette science implique dans toutes ses ramifications de variations et d'interactions qui surviennent sur ces organismes en raison des changements dans les protéines ou leurs sites actifs. Active sites L'ancrage moléculaire intervient comme une base sur laquelle reposent ces sciences, facilitant la compréhension de nombreux mécanismes qui se produisent au niveau moléculaire et proposant des solutions alternatives qui inhibent ou activent ou remplacent une partie importante du processus, à savoir la substance de base qui se lie à la protéine pour accomplir son travail ou l'inhiber. .
Cette science repose essentiellement sur un grand ensemble de bases de données. Data bases Comme base de données des protéines. Protein Data Bank (PDB) En plus du site de l'Organisation de l'alimentation et des médicaments.Food and Drug Administration (FDA) En utilisant de grands programmes de simulation qui fournissent une réalité virtuelle correspondant exactement à ce qui existe déjà dans la réalité et permettant au chercheur de modifier ou d'ajuster de nombreuses exigences, parties et éléments qui composent la protéine, et finalement fournissant au chercheur une carte tangible du type et du site de liaison qui se produit entre la substance de base et le site actif de la protéine. .
Et pour définir une matière de base Substrate (Ligand ) Pour proposer un médicament pour une maladie particulière, le chercheur doit avant de commencer à travailler étudier le site actif auquel il se liera sur le domaine protéique, et ainsi nous aurons accompli la moitié de la tâche, tout comme la création d'un port spécialisé pour l'accostage d'un grand navire, ce qui reste n'est que des procédures techniques garantissant l'arrivée et l'accostage du navire dans le port désigné de manière sécurisée et précise..
Si le chercheur souhaite développer un traitement pour une maladie particulière comme la goutte.) Gout Il est supposé qu'il étudie la protéine et le site actif sur celle-ci, puis étudie la composition chimique des préparations ou des médicaments qui ont donné de bons résultats en se liant au site actif, puis il passe aux moteurs spécifiques des extraits végétaux comme le site. Zinc Pour rechercher un composé ou un extrait qui imite ou ressemble au produit qui a donné des résultats tangibles et bons, et après avoir effectué des tests d'acceptation et de rejet, de passage et de toxicité médicamenteuse. In silico predicted Toxic Properties Ici commence une série d'opérations qui le rendent composé sous une forme ou un état lui permettant de se fixer sur le site actif, et je voudrais souligner que toutes les opérations que j'ai mentionnées ou qui seront mentionnées sont des opérations réalisées en utilisant une simulation informatique d'une grande précision et ne nécessitent pas d'entrer dans un laboratoire ou d'acheter des matériaux ou d'utiliser des appareils, et c'est en réalité ce qui confère à cette science son caractère unique car elle économise beaucoup d'efforts et de coûts pour les chercheurs et ouvre de nombreuses perspectives dans la plupart des sciences médicales et biologiques. .
Après avoir adapté la protéine et la substance de base pour se lier l'une à l'autre, nous commençons à les charger sur le programme principal en tant que programme. PyRx Ce programme effectue une simulation tridimensionnelle du processus de liaison mentionné, en plus de nombreuses caractéristiques qui permettent au chercheur de montrer ou de signaler les sites de liaison et le type de liaison (au niveau moléculaire), le programme affichant une carte bidimensionnelle représentant la liaison de chaque élément ou groupe actif dans la substance de base avec l'acide aminé correspondant sur la protéine, ainsi que le type de liaison qui les relie. .
Cela donne en réalité au chercheur une étape proactive qui l'exempte de l'expérimentation vague et aveugle sur un extrait d'une plante particulière contenant une énorme quantité de composés actifs dont l'un pourrait être la substance de base qui s'est liée au site actif, économisant ainsi des efforts et de l'argent qui pourraient ne jamais porter leurs fruits au cours de nombreuses années de recherche et d'expérimentation, tout en facilitant au chercheur un départ précoce dans le domaine de l'expérimentation sur des animaux de laboratoire et l'obtention de résultats et d'interprétations soutenues par des preuves scientifiques au niveau moléculaire. .
Pour toutes ces raisons, et parce que cette science ou cette technique est considérée comme une technique verte qui économise des efforts et de l'argent tout en tenant compte des aspects éthiques de la recherche scientifique, elle réduira considérablement le nombre d'animaux de laboratoire qui souffriront du processus de test avec des extraits inconnus, le chercheur se contentant de quelques répétitions car il a obtenu la concentration active grâce à la technique d'ancrage moléculaire que je recommande aux chercheurs dans différents domaines scientifiques d'essayer. avant de commencer Avec son expérience spécifique et en se basant sur les résultats qu'il obtiendra afin de réduire les efforts et les coûts. .
